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DNA Sequencing

Decoding Genetic Information

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Accelerate Biomarker Discovery with GENXMAP

NGS-Genxmap

We offer a comprehensive range of sequencing services tailored to meet the specific needs of your research, clinical, or industrial projects. We provide access to cutting-edge technologies such as Sanger Sequencing, NovaSeq 6000, MiSeq, MGI, and Oxford Nanopore (ONT), ensuring rapid, precise results that align with your goals.

Whether you're exploring genetic mutations, rare variants, or require whole genome analysis, we have the tools and expertise to support you at every stage. Choosing GENXMAP means partnering with a team dedicated to maximizing the efficiency and quality of your genomic analyses. Our experts work closely with you to customize each approach, ensuring tailor-made solutions perfectly aligned with the specifics of your project. By integrating precision, speed, and flexibility, we enable you to transform your data into impactful discoveries. Trust GENXMAP to advance your research with the confidence of obtaining reliable, actionable results.

High-Precision DNA Sequencing

Technologies et méthodes disponibles:

  • Séquençage Sanger

  • ​Technologie Oxford Nanopore (ONT)

  • Technologies MGI

  • Technologies Illumina

>98%

Sequencing Accuracy

300 Gb

Volume of Generated Data

10j

Average turnaround time for delivering results

Pourquoi Choisir GENXMAP ?
✅ Expertise reconnue en génomique et transcriptomique
✅ Solutions adaptées aux besoins académiques et industriels
✅ Accompagnement personnalisé et support bioinformatique
✅ Technologies de pointe et analyses rigoureuses

Advanced Sequencing, Tailored Solutions

Our sequencing services are fully customizable to meet your specific needs, ensuring precise and optimized results for each project.

NovaSeq6000

The Illumina technology is based on high-throughput sequencing, using DNA synthesis reactions to read millions of fragments in parallel. Each DNA fragment is immobilized on a surface, where fluorescent nucleotides are added one by one. The light signals generated with each addition allow for the precise determination of the DNA sequence.

Our NovaSeq 6000 service enables large-scale sequencing for the most complex genomic projects, offering unparalleled processing capacity.

Advantages:

  • Scalability: Up to 6 terabases per run.

  • Flexibility: Flow cell options to customize each project.

  • Cost-effectiveness: Optimized for large-scale studies.

Applications:

  • Whole genome sequencing (WGS)

  • Exome sequencing

  • Large-scale transcriptomics (scRNA-Seq)

MiSeq

The Illumina technology is based on high-throughput sequencing, using DNA synthesis reactions to read millions of fragments in parallel. Each DNA fragment is immobilized on a surface, where fluorescent nucleotides are added one by one. The light signals generated with each addition allow for the precise determination of the DNA sequence.

Our MiSeq is ideal for smaller-scale projects requiring speed and accuracy, especially for targeted sequencing.

Advantages:

  • Fast turnaround: Accelerated results for urgent projects.

  • Versatility: Suitable for targeted sequencing or small genomes.

  • High quality: Reliable data for clinical applications.

 

Applications:

  • Targeted genetic panels

  • Metagenomics (16S rRNA analysis)

  • Small genome sequencing (viral, bacterial)

Technologies MGI

MGI sequencing systems utilize high-throughput sequencing technology to efficiently read large amounts of DNA. They are applied in whole genome sequencing, targeted sequencing, transcriptomics, and microbiome analysis. These systems are essential for biomedical research, clinical diagnostics, and the study of genetic diseases.

Oxford Nanopore Technology (ONT)

With long reads and real-time analysis, ONT is ideal for exploring complex genomic regions and conducting on-site sequencing.

Advantages:

  • Long reads (>100,000 base pairs)

  • Real-time data

  • Portability for on-site sequencing

  • Sequencing from unconverted RNA

Applications:

  • Detection of structural variants

  • Full-length RNA transcriptomics

  • De novo assembly

  • On-site sequencing

Sanger Sequencing

Sanger sequencing remains the standard for projects requiring maximum accuracy, particularly for mutation validation.

Advantages:

  • High precision

  • Reads up to 1000 base pairs

  • Ideal for targeted sequencing

Applications:

  • Mutation detection (SNPs)

  • Validation of NGS results

  • Sequencing of specific genes

Service Details

    • Etude de projet :

      • Identification des buts scientifiques ou cliniques (par ex. analyse de mutations, étude de l’expression génique, séquençage de génomes entiers).

      • Définition des attentes en termes de précision, profondeur de séquençage et délai.

     

    • Choix des technologies :

      • Discussion sur les plateformes de séquençage disponibles (Sanger, NGS, etc.).

      • Sélection du type de séquençage adapté (génome, exome, ciblé, RNA-seq, etc.).

     

    • Analyse des échantillons :

      • Évaluation du type et de la quantité d’échantillons disponibles (ADN génomique, ARN, tissus, cellules).

      • Vérification de leur qualité et de leur compatibilité avec les techniques de séquençage choisies.

     

    • Planification des étapes du projet :

      • Définition des étapes clés : extraction, préparation des librairies, séquençage, analyse bioinformatique, livraison des résultats.

      • Estimation du délai pour chaque phase.

     

    • Validation du budget :​

      • Points abordés lors de la validation du budget

      • Coût par étape : Extraction, préparation des librairies, séquençage, analyse.

      • Volume d'échantillons : Réduction des coûts possibles pour des lots importants.

      • Technologies : Choix de la méthode la plus adaptée pour combiner performance et rentabilité.

    • Délai : Les projets urgents peuvent engendrer des coûts supplémentaires.

    • Budget fixe:

      • Une fois défini, le budget reste constant pour toutes les étapes.

      • Idéal pour les projets avec des contraintes budgétaires strictes.

      • GENXMAP ajuste le protocole ou les technologies sélectionnées afin de respecter les limites financières.

        • Avantages :

          • Transparence totale : aucun coût additionnel imprévu.

          • Permet de planifier les dépenses en toute confiance.

    • Budget flexible :​

      • Adaptation des coûts en fonction des ajustements nécessaires au projet (quantité d’échantillons, profondeur de séquençage, analyse supplémentaire).

      • Idéal pour des projets complexes ou évolutifs, où des ajustements peuvent survenir après les premières analyses.

        • Avantages :

          • Offre plus de liberté pour explorer des solutions innovantes.

          • Permet d’adapter les services à des découvertes ou besoins imprévus.

    • À l’issue de la consultation initiale, GENXMAP fournit un plan de projet personnalisé détaillant :

      • Les étapes à suivre.

      • Les technologies choisies.

      • Les besoins en échantillons.

      • Le calendrier prévu.

      • Une proposition budgétaire transparente.

      • Des conseils pour optimiser la préparation ou l’envoi des échantillons, si nécessaire.

    • ​Types de séquençage proposés:

    • Séquençage Sanger (classique). ​Méthode traditionnelle pour des séquences courtes (jusqu'à 1 000 pb).

      • Applications :

        • Vérification de mutations ponctuelles.

        • Validation de constructions plasmidiques.

        • Contrôle qualité des séquences clonées.

    • Séquençage de nouvelle génération (NGS) : Analyse à haut débit pour des projets complexes ou volumineux.

      • Technologies utilisées :

        • Illumina pour une grande précision et une couverture élevée.

        • Autres plateformes disponibles en fonction des besoins (ex: Oxford Nanoporetechnology).

      • Applications :

        • Whole Genome Sequencing (WGS) : Séquençage complet de génomes.

        • Whole Exome Sequencing (WES) : Ciblage des régions codantes du génome.

        • Targeted Sequencing : Séquençage ciblé sur des régions spécifiques.

        • Détection de mutations, variations structurales et polymorphismes.

    • Étape 1 > Préparation des échantillons

      • Acceptation de divers types d’échantillons :

      • ADN génomique purifié (idéalement >50 ng/µL).

      • Tissus, cellules, ou fluides biologiques pour extraction par GENXMAP.

      • Contrôle qualité des échantillons :

      • Mesure de la concentration (Qubit, NanoDrop).

      • Évaluation de l’intégrité via électrophorèse ou Bioanalyzer.

    • Étape 2 > Préparation des librairies

      • Adaptation de la préparation en fonction :

      • Du type d’échantillon (ADN génomique, plasmides, PCR, etc.).

      • De l’objectif du projet (ciblage, exome, transcriptome).

      • Options de personnalisation pour des besoins spécifiques.

    • Étape 3 > Séquençage

      • Exécution sur la plateforme sélectionnée (Sanger ou NGS).

      • Ajustement de la profondeur de séquençage pour répondre aux exigences de couverture et de sensibilité.

    • Étape 4 > Analyse bioinformatique

      • Traitement des données brutes :

      • Alignement des lectures sur une référence génomique.

      • Identification des variants génétiques (SNP, CNV, InDel, etc.).

      • ​Assemblage de novo si nécessaire.

      • ​Fourniture de fichiers standards (FASTQ, BAM, VCF) et de rapports personnalisés.​​
         

    • Étape 5 > Livraison des résultats

      • Résultats transmis via un espace sécurisé ou via un disque externe de stockage.

      • Support technique pour interprétation et exploitation des données.

    • Option 1 : Service clé en main >> Idéal pour les clients souhaitant externaliser tout le processus. Prise en charge complète du projet, de la réception des échantillons à la livraison des résultats analysés.

      • Comprend :

        • Extraction et purification des acides nucléiques.

        • Contrôle qualité (Qubit, NanoDrop, Bioanalyzer).

        • Préparation des librairies adaptées au type de séquençage.

        • Séquençage sur plateforme sélectionnée.

        • Analyse bioinformatique complète et rapport interprété.
           

    • Option 2 : Service partiel (à la carte) >> Idéal pour les laboratoires disposant de capacités internes mais nécessitant une expertise pour des étapes spécifiques. Permet aux clients de choisir uniquement certaines étapes du processus.

      • Exemples d’étapes à choisir :

        • Préparation des librairies.

        • Séquençage uniquement (Sanger ou NGS).

        • Analyse bioinformatique avancée (alignement, détection de variants, etc.).
           

    • Option 3 : Séquençage standard >> Idéal pour les clients disposant d'une équipe bioinformatique interne (Fourniture des données brutes sans analyse supplémentaire).

      • Comprend :

        • Séquençage de l'ADN ou ARN purifié.

        • Contrôles qualité de base.

        • Fichiers de sortie (FASTQ, BAM).
           

    • Option 4 : Choix des technologies de séquençage

      • Séquencage Sanger >> Méthode classique, précise et rapide pour des séquences courtes (jusqu'à 1 000 pb).

        • Applications :

          • Vérification de mutations ponctuelles.

          • Validation de constructions plasmidiques.

          • Analyse ciblée.
             

      • Séquençage NGS (Next-Generation Sequencing) >> Analyse à haut débit, adaptée aux projets complexes ou volumineux.

        • Options disponibles :

          • Whole Genome Sequencing (WGS) : Séquençage complet d’un génome.

          • Whole Exome Sequencing (WES) : Séquençage des régions codantes uniquement.

          • Targeted Sequencing : Séquençage de régions génomiques spécifiques.

          • Séquencage personnalis :  Adapté aux projets spécifiques nécessitant un design unique (par ex. métagénomique ou études d’interaction hôte-pathogène).
             

    • Options 5 : Analyse bioinformatique

      • Analyse basique

        • Traitement des données brutes pour fournir :

        • Alignement des lectures.

        • Fichiers FASTQ, BAM ou VCF.

      • Analyse avancée >> Adapté aux exigences réglementaires ou cliniques si nécessaire.

        • Intégration de méthodes bioinformatiques approfondies :

        • Détection des variants (SNP, InDel, CNV).

        • Assemblage de novo.

        • Analyse différentielle (expression génique, RNA-seq).

        • Rapports personnalisés

        • Résultats interprétés avec graphiques et explications détaillées.
           

    • Option 6 : Flexibilité selon le volume et la profondeur

    • Volume d’échantillons : Tarifs dégressifs pour des lots importants.

    • Profondeur de séquençage :

    • Options standard pour des analyses générales.

    • Profondeur élevée pour détecter des mutations rares ou explorer des génomes complexes.

Options

Access our sequencing solutions and obtain precise and in-depth genetic analyses.

GENXMAP, your trusted partner to support you in your research.

Advantages & Differentiation

A comprehensive multi-omics approach with flexible analysis and rigorous validations, ensuring accurate and actionable biomarkers for research and personalized medicine.

🔬 Complete & Integrated Approach

Biomarker Xplorer combines DNA, RNA, and proteins, providing a holistic view of biological phenomena.

🎯 Flexibility & Modularity

Each client can create their own analysis package based on their specific needs, ranging from simple extraction to advanced analysis and experimental validation.

🧠 Advanced Bioinformatics Expertise

Our analysis tools enable precise detection of genetic variations and differential expression profiles, with relevant functional annotations.

✅ Rigorous Experimental Validation

The identified biomarkers can be validated by qPCR, dPCR, and proteomics, ensuring their robustness and clinical relevance.

🚀 Accelerating Research & Clinical Applications

Our approach helps refine diagnostics, personalize treatments, and optimize therapeutic development.

Optimized and Transparent Services

  • Our Go/No-Go processes allow you to track the progress of your project in real-time. At each stage, you validate the transition to the next, ensuring complete control and maximum transparency throughout the entire process.

  • Our optimized timelines ensure fast and efficient execution of each project while meeting your specific requirements. This system ensures proactive time management, minimizing delays and maximizing productivity to deliver results that align with your expectations.

  • Our tailored processes are designed to meet the unique needs of each project, offering flexibility and personalized follow-up. This system ensures rigorous control while delivering accurate results that align with your expectations.

  • Our detailed analyses guarantee reliable and in-depth results tailored to each study. With cutting-edge tools and proven methodologies, we provide a precise understanding of genetic data, while adhering to the highest standards of quality and scientific rigor.

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